При поиске корня в существительном «пробежка» воспользуемся стандартной схемой. Для начала найдём словоизменительную морфему и основу. Сделаем это с лёгкостью, если просклоняем лексему: пробежкой, пробежки. Окончание в именительном падеже – «а». Остальную неизменяемую часть выделим как основу – «пробежк».
Посмотрим, если ли в этом примере другие морфемы. Для этого сравним ряд родственных слов. Например: набег, бегать, убежать, бегунья, выбежать, забег, прибегать. Общая значимая часть представлена несколькими вариантами – «беж» и «бег». Мы имеем дело с корневым чередованием «ж» – «г». Однако конечная согласная в анализируемом слове – «ж».
Следовательно, корень – «беж».
Кроме того, вычленим префикс «про» и суффикс– «к».