В данном существительном не так просто найти главную значимую часть. При изменении формы мы её не увидим. В косвенных падежах в корне происходит выпадение гласной буквы «е».
Это хорошо видно, если записать хотя бы две формы существительного в транскрипции – [мурав’эй’|мурав’й’а]. Как видим, между звуками [в’] и [й’] в Р. п. выпадает звук [э], обозначаемый на письме буквой «е». То же самое происходит во всех косвенных падежах.
Чтобы найти корень, необходим подбор однокоренных слов. Их немного, но они есть: муравейник, муравейчик, муравейный. Общая часть – «муравей».
Следовательно, корень – «муравей».
Слово состоит из основы, которая совпадает с корнем, и нулевого окончания.