Чтобы выделить корень, нужно изменить его форму: скворец –скворца. Корень очевиден – «скворец». Но, возможно, кого-то смущает то, что в косвенных падежах нет полного совпадения – исчезает буква «е». Это беглая (редуцированная) гласная «Ь» – «ерь», она праславянского происхождения, от – «skvorьcь».
Поэтому в ударной позиции, в И. п., буква «Ь» читается в как [э] и пишется как «е», а в безударном положении, в форме косвенных падежей, она исчезает.
Возможно, кто-то спросит, почему в родственных словах не совпадают согласные на конце корня, например: скворец – скворечник. И это объяснимо: происходит чередование согласных букв ц/ч.
Следовательно, корень в слове скворец – «скворец».